一方面，百果园试图通过削减供应链环节、自建加工配送中心来降低损耗，提升效率，并在2021年努力提高自有品牌比重，将净利润率提升到4%，但资本市场反应冷淡，其市值一年内蒸发了51亿，跌幅达到54%。
另一方面，门店扩张之路并不顺利。尽管百果园在全国拥有6000多家门店，遍布超过150个城市，其中加盟门店占比高达99%，但加盟商的日子愈发艰难。由于高昂的房租、人力成本以及需自行承担的水果损耗，加上总部抽成，加盟商门店经营利润率仅维持在5%-8%左右，不少门店在开业2-3年内就因回本无望而转让。
面对生鲜电商的冲击，百果园也尝试在线上渠道发力，然而成效甚微。2020年线上收入占比虽有所提升，但由于包装和配送成本过高，线上业务毛利率竟然是负数。更令人关注的是，水果零售市场的痛点在于难以实现规模效应与品牌溢价。相较于百果园等零售商的薄利现状，真正赚钱的是掌握源头种植、成功打造品牌的公司，如新西兰的佳沛奇异果。这些品牌通过专利种子、精细化种植管理及营销策略，成功实现了高定价和市场认可度，从而获取了行业内的丰厚利润。
总的来说，百果园面临的内外交困局面包括但不限于线下门店扩张瓶颈、线上业务盈利难、以及生鲜电商的竞争压力。要想在万亿级的水果零售市场中突围，百果园或许需要借鉴佳沛的成功经验，深入产业链上游，重塑商业模式，打造自有品牌，才有可能打破目前的盈利困境。
