刘毓文团队与清华大学团队携手,利用AI实现对DNA逆式调控元素设计的新突破

2024-10-24 生活常识 关注公众号
刘毓文团队与清华大学团队携手,利用AI实现对DNA逆式调控元素设计的新突破
中国的农业科学院深圳基因组研究所和清华大学合作开发出的基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法DREAM。它具有高度的可扩展性和解释性,可以自动设计启动子、增强子和沉默子。该方法首次设计出了具有保守功能的增强子序列,在多个物种中表现出超强的调控活性。同时,文章还介绍了一个基于深度学习的从头设计方案,但目前仍存在优化空间和激活效果有限的问题。这为基因组提供了新的可能性。

中国农业科学院深圳基因组研究所和清华大学合作开发出的基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法DREAM。这一研究标志着我们对DNA编程和调控的理解迈入了全新的阶段。
DREAM采用了高度可扩展性的设计理念,使得我们可以根据需要调整系统的参数,从而实现精细调控。这种设计理念使得我们的系统在进行复杂的调控任务时,也能保持高效运行。
此外,DREAM还具有高度的解释性。通过分析设计结果,我们可以理解每一个参数是如何影响调控结果的,从而更好地理解和应用这些调控元件。
其中,首次设计出了具有保守功能的增强子序列,在多个物种中表现出超强的调控活性。这一发现不仅为我们打开了新的可能性,也为未来的基因工作指明了方向。
然而,尽管DREAM有着显著的优点,但在实现最大化调控活性的同时,我们还需要不断优化它的性能。目前,关于如何提高其激活效果,以及如何进一步提升其可扩展性等问题,仍然是我们需要深入研究和解决的问题。
总的来说,Dream的诞生无疑开启了基因组的新篇章,为我们在生物科学领域的发展带来了新的机遇。我们期待未来Dream能够发挥更大的作用,帮助我们更好地理解生命的奥秘,并为人类健康和福祉做出贡献。

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