北京大学汤富酬团队又有新成果,推出更先进的单细胞全基因组测序技术。

2024-03-09 生活常识 关注公众号
    北京大学汤富酬团队开发革命性单细胞全基因组测序技术——Refresh-seq,显著提升等位基因检测能力
北京大学汤富酬团队再发文:新的单细胞全基因组测序方法    
北京大学汤富酬团队再发文:新的单细胞全基因组测序方法    在转化医学的前沿领域中,单细胞全基因组测序技术在过去十年间取得了重大突破。然而,由于等位基因缺失问题的存在,即在单个二倍体细胞中无法同时捕捉到两个等位基因信息,这在很大程度上限制了该技术在医学研究及临床应用中的潜力,特别是在植入前遗传诊断等方面。
北京大学汤富酬团队再发文:新的单细胞全基因组测序方法    2024年3月5日,《Cell Discovery》期刊发表了一篇由北京大学汤富酬团队主导的研究论文,题为“Mapping crossover events of mouse meiotic recombination by restriction fragment ligation-based Refresh-seq”。研究团队创新性地将限制性内切酶切割与连接策略结合第三代测序(TGS)平台,研发出名为Refresh-seq的新一代单细胞长读取基因组测序技术。相较于现有的SMOOTH-seq方法,Refresh-seq能够大幅提升基因组覆盖率和一致性,尤其显著提高了对二倍体细胞中两种等位基因的捕获率,即使在较浅的测序深度下也能展现出卓越的性能。
    Refresh-seq的独特优势在于其均匀性和低等位基因脱落率,使得该技术在非整倍体精子和卵母细胞筛查方面具有广泛的应用前景,并且对于高度重复或低复杂性基因组区域内的结构变异(SVs)检测也更具优势。此外,Refresh-seq库构建过程高效便捷,成本低廉,单管版本的成本仅为每细胞3.6美元,而通过微流控技术进行样本处理时,成本甚至更低,且能进一步提高基因组DNA相对浓度,从而增强连接效率和PCR效果。
    总结来说,北京大学汤富酬团队研发的Refresh-seq技术不仅解决了长期以来困扰单细胞全基因组测序领域的等位基因缺失难题,还凭借其出色的性能、简便的操作流程和经济的成本,在生命科学和医学领域开辟了全新的研究路径,对于遗传疾病的早期预防、诊断和治疗方案的设计具有重大的现实意义。

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